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SCI医学编译顾问-林先生

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成功在 PLoS One 发表2篇文章的经验  

2015-07-17 12:01:57|  分类: 默认分类 |  标签: |举报 |字号 订阅

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  笔者投PLoS ONE 的文章又被接收了。这是笔者第二篇PLoS ONE,也是第一篇真正意义上的论着(第一篇是meta分析,同样投该杂志)。从成文到发表,该文算是命运多舛,期间得到很多贵人的帮助,并在此基础上成文的。虽然不是很牛的杂志,依然愿意将自己自立题,写作,投稿,发表等一系列经验与大家分享,希望能够对同投该杂志的战友们有所帮助。

 

  (1)立题及写作

 

  这篇文章是一个临床研究,观察重症胰腺炎中两个指标(A指标和B指标)的相关性,数据来自我们科室多年前所做的一个多中心、随机对照、前瞻的临床研究数据库。之前在其他疾病中这一块都说A指标与B指标呈正相关。

 

  由于数据库是我偶然得到,我最开始也仅仅是想做一下A指标和B指标的相关性,来验证下我所拿到的数据库。这个时候问题来了:我所做的结果并不是A与B呈正相关,而是在一定范围内正相关分布,超过介值后,反而呈反相关分布。这个时候我就怀疑数据的真实性。

 

  在向科室收集数据的副教授做了进一步确认和讨论,并且做了相应的统计学校正后,依然有这个关系,我就确认这个关系是客观存在的,而且是一个别人未报道过的新发现,就开始着手查文献准备写作。

 

  这是我的第一篇英文临床论着,通过这个过程认识到:临床论文一定要相信自己拿到的数据,如果你的数据和别人之前的报道不一样,那背后一定有原因,这个原因或许就是一篇新的论文的立足点。

 

  然后就是收集资料写作。主要是看看是否有相关的因素同时影响到A和B,是否超过一定介值后A和B这种正相关关性就被打破了。在此要非常感谢哈佛大学的陈常中教授团队,该论文的统计学分析全部来自于他们,陈老师以及论文实际贡献者也是作为该论文的作者。

 

  在论文成文之后,我就面临一个作者分配的问题:该课题是2007年到2008年实施,由科主任牵头,科室一个副教授收集的我们中心的数据,而该文章是在导师的指导下我完成的。同时,数据来源还有来自于国内其他3个中心的贡献,涉及到多方面利益分配的问题。

 

  最后是和科室的人讨论,并且在请教过医刊汇编辑教授后,得出一个折中的方案:文章中明确注明数据来源,我和科室副教授为共同第一作者,导师和科主任作为共同通讯作者,其他实际贡献者(如数据的实际处理,统计分析,论文修改等等)按贡献大小放在中间,其他单位放在文章末尾的致谢中。我觉得,对于这种多方面均有贡献的论文,最好是在投稿之初就要确定好作者顺序,并且一定要知会本人,如果发表后再来擦屁股,大家都会很不爽。

 

  此外要非常感谢医刊汇编辑教授,在该论文的成文过程中,他做了多次点评,指出了核心问题,并且对于作者,还有怎样标注数据来源等,他也做了一些非常具体的指导。我也在征得他的同意后将他放在文章的致谢中。很多同学似乎并不想指导自己的文章被公司编辑过,这个我觉得大可不必,客观就行。能够将这个事情大方的说出来,对别人也是一种尊重和感谢。还有港大的罗娜老师以及我的一些同学等,他们都对该论文有实际的贡献。

 

  (2)投稿

 

  受医刊汇编辑教授影响甚深,他对于该文的投稿意见是“要发表在同行能够看到的地方,而不应该追求IF”。所以最开始所选择的都是胰腺,重症或者胃肠病相关的专业杂志。但是由于数据的缺陷,很多Reviewer都觉得文章立题不错,但是仅仅提出假设,没有具体数据验证,无法接收。在频招打击的情况下,又将这个文章投到PLoS ONE。

 

  投这个杂志,大修1次,小修3次才算最终落地。在回答Reviewer的问题的过程中也极其有意思。有个Reviewer非常明确的对我的数据提出质疑:我们对于临床病人从来不检测血液的细胞因子,你们是怎么做到的?这个时候就是要用充分的事实将他拍熄火。我感觉对于Reviewer的回复就是一个博弈的过程,只要有礼貌的回复,并且有充分的依据,一般不会有问题。临床论文,又不涉及补实验。

 

  投稿的时间非常长。非常有趣的是,我和师弟同时投这个杂志,都是胰腺炎相关的题材,两篇文章都是在同一个Acdemic Editor手中。虽然比较苛刻,但最后都顺利接收。

 

  以下是具体的投稿日志:

 

  9月23日,投稿,manuscript submitted to journal

 

  10月1日,under review

 

  10月31日,decision in process

 

  11月3日,major revision

 

  11月13日,上传修改稿,Manuscript submitted to journal。大概3周后发邮件问过一次是否接收到我的文章,Editor回复说我的文章还在in-house editor手上,首先他们要看格式是不是对的;

 

  12月7日,manuscriptsend back to author,意见是说我的文章中没有标明support information legends(现在PLOS ONE要求在这个部分上传原始数据,之前没有注意到,耽误快一个月);

 

  12月10日,修改完毕,上传再次修改后的稿件,manuscript submitted to journal.

 

  12月21日,With editor.

 

  12月22日,Under review.

 

  1月26日,Decisionin process.

 

  1月27日,第一次Minor Revision.

 

  2月1日,上传小修的修改稿,manuscript submitted to journal.

 

  2月3日,With Editor.

 

  2月4日,Decisionin process.

 

  2月5日,第二次Minor Revision,Academic Editor提出"you should check the professional terminology and linguistics of the paper"。

 

  2月11日,上传小修稿,manuscript submitted to journal.

 

  2月12日,With Editor后迅速变为Under Review.

 

  3月15日,第三次Minor Revision,要求修改中间的一个错误单词。实在被弄疲惫了,丢了一个多月没动。

 

  4月26日,截止日前一天上传小修稿,manuscript submitted to journal.

 

  4月30日,收到邮件说Accept。

 

  需要注意的是这个杂志现在要求提供原始数据,一定要在文章中注明原始数据,并且要以附件的形式上传。我是这样标注的:

 

  Supporting Information Legends

 

  S1 Table. Relevant data underlying the findingsdescribed in manuscript.

 

  这个在正文中一定要有,不然他会给你打回来,浪费时间。

 

  以上就是我关于这个文章的一些经验,更多的谈到了关于写作过程。很多人都对该论文有具体的贡献,而我仅是一个信息整合者。通过该论文,对我最大的帮助并不是发表,而是临床数据的分析,以及发表的一些伦理问题,还有作者分配的问题。

 

  当然,还有合作,这个很重要。很多东西,只有合作,才能够更快的出成果,自己一个人的力量毕竟有限,而且也不要害怕和别人分享成果。这大概是该文成文及投稿的过程,希望对大家有所帮助。

成功在 PLoS One 发表2篇文章的经验 - 医刊汇 - 医刊汇5022林先生

 

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